Javna ustanova za upravljanje zaštićenim prirodnim vrijednostima na području Koprivničko-križevačke županije sa sjedištem u Koprivnici, Nemčićeva 5, osnovana je temeljem članka 17. stavka 3. Zakona o zaštiti prirode („Narodne novine" broj 30/94 i 72/94) i članka 7. i 12. stavka 3. Zakona o ustanovama („Narodne novine" broj 76/93), Odlukom županijske skupštine Koprivničko-križevačke županije o osnivanju Javne ustanove za upravljanje zaštićenim dijelovima prirode na području Koprivničko-križevačke županije („Službeni glasnik Koprivničko-križevačke županije" broj 16/96). Upisana je u sudski registar kod Trgovačkog suda u Bjelovaru 10. prosinca 1997. godine s matičnim brojem subjekta 010036938. Započela je s radom 1. travnja 1998. godine.  

Dana 11.03.2005. Županijska skupština Koprivničko-križevačke županije donosi Odluku o izmjenama i dopuni Odluke o osnivanju Javne ustanove za upravljanje zaštićenim dijelovima prirode na području Koprivničko-križevačke županije kojom se na temelju članka 7. i 12. stavka 3. Zakona o ustanovama („Narodne novine" broj 76/93,29/97 i 47/99) i članka 171. Zakona o zaštiti prirode („Narodne novine" broj 162/03 i 100/04) mijenja naziv ustanove i usklađuje djelatnost ustanove. Trgovački sud u Bjelovaru dana 01. 12. 2005. izdaje Rješenje da je u sudski registar upisana promjena naziva ustanove iz „Javna ustanova za upravljanje zaštićenim dijelovima prirode na području Koprivničko-križevačke županije" u „Javna ustanova za upravljanje zaštićenim prirodnim vrijednostima na području Koprivničko-križevačke županije", te ostale promjene.